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大连做网站优化互联网推广工作好做吗

大连做网站优化,互联网推广工作好做吗,如何免费学校建网站,无锡网站建设 微信目录 关于umi矩阵学习 用umi计算feature、counts值 ①meta数据查看 ②Count和Feature计算(生成Seurat时自动计算) 1)提取UMI矩阵 2)计算 其他指标 评估质量指标(重点) 1)UMI计数 2)基因计数 3)UMIs vs. genes detected 4)线粒体计数比率 5)综合过滤 过…

目录

关于umi矩阵学习

用umi计算feature、counts值

①meta数据查看

②Count和Feature计算(生成Seurat时自动计算)

1)提取UMI矩阵

2)计算

其他指标

评估质量指标(重点)

1)UMI计数

2)基因计数

3)UMIs vs. genes detected

4)线粒体计数比率

5)综合过滤

过滤提取子集

关于umi矩阵学习

10X数据因为有UMI,不需要考虑基因长度的影响,但仍然需要考虑测序深度在不同细胞之间的差异,所以需要用函数LogNormalize进行处理,具体方法是用该基因的UMI/该细胞的全部UMI,再乘以10000,在按列LogNormalize后,又可以按行进行scale​​,以去除极大值极小值基因对数据的影响。关于单细胞TPM、Count数据的处理_rds文件的umicount和readcount是什么-CSDN博客

用umi计算feature、counts值

scRNA-seq质量控制流程scRNA-seq—质量控制 (qq.com)

①meta数据查看

http://www.wooajung.com/news/33457.html

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